Khon Buri trong tiếng Thái nghĩa là nguồn sông, liên quan đến các phụ lưu của sông Mun ch đơn vị này có tên Ban Khon Buri. Thị xã này đã được đổi tên thành Mueang Khon và sau đó là Khon Buri.

Năm 1907, khu vực này là tiểu huyện (King Amphoe) của huyện Chok Chai. Tiểu huyện có tên King Amphoe Chae do trung tâm thị xã ở tambon Chae.

Do tambon Khon Buri cách xa trung tâm của huyện Pak Thong Chai, chính quyền đã gộp đơn vị này quản lý chung với phó huyện Chae năm 1939. Đồng thời, đơn vị này được chính thức nâng cấp thành huyện và đổi tên thành Khon Buri.